現在疫苗施打都由中央管理配發，但台北市長柯文哲卻在記者會上抱怨，北市以前常被攻擊疫苗打太慢，但現在有了唐鳳的預約系統，施打速度反而變比較慢，甚至爆料台北還有20萬劑庫存快過期，但市府卻馬上改口「是口誤」，實際快到期的數量，約9580劑到1.3萬劑。
武肺疫苗施打速度加快，已來到第三輪！但過去疫苗施打都由地方全權負責，政務委員唐鳳系統上線後，7月中就改成中央主導，台北市長柯文哲對此，頗有意見。
台北市長柯文哲說，「結果我去看，每天疫苗都剩一大堆，為什麼你知道，你發下來我去打一定效率比較快，因為我們跟，我們自己手上有多少疫苗，我們要去打多少，我們自己會會督促，現在直接從中央再去連絡醫院，然後再去造冊去打，這速度一定比較慢啦。」
不只認為，中央負責後，反而拖慢北市施打速度，柯文哲還進一步爆料：「就會開始出現說，疫苗快要到期了，然後...然後...，快要到期的疫苗就一大堆，我算一算單單台北市，我看前幾天我看那個庫存就有20萬劑。」
但柯文哲才說，單單北市疫苗庫存，就有20萬劑快要過期，市府卻馬上改口，說柯文哲的數字是口誤。實際數字，7月27日就到期的有91瓶、31日到期327瓶，還有540瓶8月3日才過期，真正快過期的量應該是958瓶，約9580劑到1.3萬劑，和柯文哲說的20萬劑，真的差很大！
指揮中心發言人莊人祥也解釋說，「之所以有過期的問題，是因為莫德納疫苗解凍後，只能存放30天，扣掉解凍期2天就只剩28天，7月29日之前到8月2日之間屆效，事實上台北市只有1200劑，還有一些是一到三類，還有孕婦都要打第二劑，所以我就請他們加速施打，如果有要屆效我們中央會把他收回來，就給第七類相關人員來施打。」
指揮中心強調，如果真的有屆效疑慮，會提前3、4天收回，不過柯文哲抱怨之餘還爆出錯誤數字，再度引發爭議。
（民視新聞／綜合報導）
